Grâce à son talent et malgré le fait que son seul professeur François Huot n'ait été qu'un amateur, Lavigueur devient un violoniste recherché dont le phrasé et le coup d'archet « remuaient vivement la sensibilité des auditeurs ».

Professeur au Petit Séminaire de Québec (1853-1881), on le reconnaît comme l'un des premiers compositeurs d'oeuvres lyriques du pays. Il est l'auteur d'une opérette en trois actes La Fiancée des bois (livret de Pamphile Lemay), et d'un opéra-comique Un mariage improvisé. On lui doit aussi de nombreux chants dont le plus populaire, La Huronne, est presque devenu à l'époque un hymne patriotique à cause du message sous-entendu qu'il contenait.